Istoria Institutului incepe cu anul 1949, cind a fost fondata Sectia Geologie in cadrul Filialei Academiei de Stiinte a fostei URSS, care s-a preocupat cu studierea structurii geologice si a resursele minerale ale Republicii Moldova.

In 1954 in cadrul acestei filiale a fost creata statia seismica de baza "Chisinau", care a inceput investigarea regimului seismic al cutremurelor Carpatiene.

In 1958 Sectia de Geologie din cadrul Academiei de Stiinte al fostei URSS, a fost reorganizata in Institutul de Geologie si Resurse Minerale.

In 1967 in baza Institutului de Geologie si Resurse Minerale si a statiei seismice de baza "Chisinau", a fost fondat Institutul de Geofizica si Geologie al Academiei de Stiinte, care a fost condus de N.Burghelea, doctor in geologie iar din 1970 de catre academicianul, doctor habilitat in stiinte geologice si mineralogice A. V. Drumea. Actualmente Institutul de Geologie si Seismologie activeaza sub conducerea d-lui Vasile Alcaz, doctor habilitat in geofizica.

La momentul crearii in Institut activau 35 de colaboratori, inclusiv 3 dr.hab si 6 doctori in stiinta. In prezent, in cadrul Institutului activeaza 82 de persoane, inclusiv 27 cercetatori stiintifici, dintre care 3 doctori habilitati, 10 doctori in stiinta, ingineri si tehnicieni. Institutul are in componenta sa 5 laboratoare si un Centru de monitorizare seismica.

In linii generale, rezultatele obtinute de Institut contribuie la cunoasterea mai profunda a problemelor fundamentale ale seismologiei, particularitatilor mecanismului focarului Vrancea, clarificarea unor probleme fundamentale a stratigrafiei, evolutiei crustei terestre in anumite perioade geologice, neotectonicei, hidrogeologiei si geologiei ingineresti, geochimiei, in deosebi ce tine de protectia mediului.

Efectul economic si social al cercetarilor Institutului consta in asigurarea protectiei antiseismice a populatiei, minimizarea pierderilor cauzate de cutremurele de pamint si procesele geologice distructive. In fiecare an Institutul efectueaza lucrari de expertiza stiintifica la comanda directa a Guvernului Republicii Moldova si participa la pregatirea a diferitor proiecte de Hotariri ale Guvernului.